莆田市秀屿区工商行政管理局前身是莆田市湄州湾北岸工商局，成立于1996年，2002年因行政区划调整更名为莆田市秀屿区工商局。局机关建立党总支，下属7个党支部，并成立了工会、团支部。秀屿区工商局坚持以人为本，着力加强基层规范化建设、信息化建设和干部队伍建设，提高依法行政能力，提升监管效能，深化行政指导，落实优惠政策，实施商标品牌战略，推进港城新区建设。2003年秀屿区工商局被福建省省委、省政府评为福建省“文明单位”，被福建省工商局、福建省档案局评为“省级先进档案室”，被莆田市委、莆田市政府评为“市级花园式单位;笏石工商所被共青团莆田市委、莆田市工商局评为“市级青年文明号”。2004年区工商局被福建省工商局评为“2003年度整顿和规范市场经济秩序先进单位”;笏石工商所被福建省工商局评为“福建省十佳工商所”，被福建省人事厅、福建省工商局评为“福建省工商行政管理系统先进集体”，被共青团福建省委、福建省工商局评为“省级青年文明号”，被莆田市委、市政府评为莆田市“文明单位”;埭头工商所被莆田市委、市政府评为莆田市“文明单位”、“计划生育工作先进单位”。2006年区工商局被福建省委、省政府评为福建省第九届“文明单位”，被福建省法制宣传领导小组评为“01-05年全省法制宣传教育先进集体”。2007年埭头工商所被莆田市委、市政府评为莆田市“2004-2006年度文明单位”，笏石、东庄、忠门、南日工商所被秀屿区委、区政府评为秀屿“2004-2006年度文明单位”。”2006-2008年连续三年秀屿区工商局被评为秀屿区“服务经济发展先进单位”;2010年秀屿区工商局被评为莆田市第十一届“文明单位”。